
蛋白质棕榈酰化修饰不稳定,往往需要通过间接的方法来检测,常用的方法有:
细胞内标记法:通过细胞代谢标记棕榈酰化类似物,再通过点击化学(Click chemistry)标记上探针,再进行酶切,并使用链霉亲和素树脂特异性富集标记有生物素的肽段(原棕榈酰化肽段),洗脱肽段后使用质谱仪进行检测。
酰基生物素交换法(ABE):蛋白质棕榈酰化修饰先经过 ABE 法被还原为游离巯基(-SH)并被标记上生物素,随后进行酶切,并使用链霉亲和素树脂特异性富集标记有生物素的肽段(原棕榈酰化肽段),洗脱肽段后使用质谱仪进行检测。
以上两种方法相互补充,大大降低假阳性,并显著提高棕榈酰化蛋白质修饰的检出率与覆盖度,同时结合高分辨率质谱检测的方法,在准确相对定量、全蛋白质组范围内获得优越表现。

送样要求:
| 样本类型 | 样品量 |
| 新鲜动物组织 | ≥500 mg |
| 新鲜植物组织 | ≥5 g |
| 细胞 | ≥1×10? cells/tube |
| 真菌或细菌 | ≥600 mg |
| 血清或血浆 | 450 μL |
| 蛋白溶液 | 5–10 mg |
| 体液(如尿液) | 15 mL |
| 体液(如唾液,细胞培养上清) | >15 mL |
参考文献:
[1] S Mesquita F, Abrami L, Linder ME, Bamji SX, Dickinson BC, van der Goot FG. Mechanisms and functions of protein S-acylation. Nat Rev Mol Cell Biol. 2024;25(6):488-509.
[2] Zhang M, Zhou L, Xu Y, et al. A STAT3 palmitoylation cycle promotes TH17 differentiation and colitis. Nature. 2020;586(7829):434-439.
[3] Bu L, Zhang Z, Chen J, et al. High-fat diet promotes liver tumorigenesis via palmitoylation and activation of AKT. Gut. 2024;73(7):1156-1168.