TCGA与GEO数据库再挖掘分析

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TCGA与GEO数据库再挖掘分析

TCGA、NCBI GEO、NCBI SRA、EBI ArrayExpress等是含有高通量数据的数据库，其中TCGA是一个非常权威的、数据量巨大的、组学丰富的、免费的癌症公共数据库。我们可以基于它进行很多挖掘分析，获得很多结果。

常用的再挖掘分析有：

① GEO或者TCGA数据分析

② GEO和TCGA数据联合分析

③ DNA、RNA组学联合分析

④ RNA、蛋白质组学联合分析

案例1：GEO和TCGA分析、样本验证

案例2： GEO、TCGA的多数据集的交叉差异分析

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