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Science , 中山大学肿瘤防治中心康铁邦等揭示表观遗传调控新机制
时间:2025-06-19   浏览:241次

2025529日,中山大学肿瘤防治中心康铁邦/武远众团队在ScienceIF=44.7)上发表了题为“ASB7 is a negative regulator of H3K9me3 homeostasis”的研究论文。本研究揭示了CUL5ASB7 E3泛素连接酶是H3K9me3稳态的有效负调节因子,通过HP1-SUV39H1-ASB7介导的平衡,控制着H3K9me3进行细胞周期依赖性精准重建。
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01、ASB7限制H3K9me3具有普遍性

以组蛋白 H3 赖氨酸 9 三甲基化(H3K9me3)为标志的异染色质,对基因组稳定性和基因抑制至关重要。然而,细胞如何防止 H3K9me3 过度积累一直不明确。为了揭示细胞周期中能精确限制H3K9me3的机制,研究人员利用全基因组CRISPR-Cas9进行敲除筛。⑾ASB7被敲除后,H3K9me3富集最显著。CUT&RUN实验发现,在 ASB7 缺失的细胞中,靶向切割与核酸酶释放测序显示,全基因组范围内的 H3K9me3 信号显著增强,包括信号增强区域、扩散区域和新增区域。Western blot和免疫荧光染色进一步证实了该结果。根据GTEx数据库发现ASB7 广泛表达,且在不同组织来源细胞系实验发现,ASB7耗竭后H3K9me3水平升高,表明ASB7限制H3K9me3水平是普遍作用。
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02、HP1招募ASB7至异染色质区域

研究人员通过细胞分级分离发现,ASB7富集在染色质上并与H3K9me3共定位,表明ASB7是异染色质相关蛋白。基于TurboID的邻近标记测定法,发现ASB7富集了异染色质相关蛋白质(如SUV39H1)和HP1家族成员(HP1α、HP1βHP1γ)等成分。
为确定HP1是否促进ASB7招募到异染色质,研究人员进行了一系列实验,结果发现ASB7与HP1在异染色质共定位且ASB7与HP1的CSD相互作用,HP1敲低/结构域缺失会破坏ASB7异染色质定位。由于HP1 CSD二聚体为含有PxVxL基序的效应蛋白提供对接平台,且ASB7含有三个候选PxVxL基序,通过分别构建3个突变体(PxVxL1-3)实验发现,PxVxL1突变严重破坏了ASB7-HP1相互作用,并破坏了ASB7在异染色质的定位。表明,HP1的CSD与ASB7的PxVxL1相互作用将ASB7招募到异染色质。

03、ASB7介导SUV39H1泛素化降解

CUL5ASB7是负责底物降解的E3泛素连接酶,于是研究人员推测ASB7通过降解H3K9me3调节因子限制H3K9me3水平。通过定量蛋白质组质谱检测分析发现,ASB7过表达可显著降低H3K9me3甲基转移酶SUV39H1丰度。ASB7敲除/CUL5敲低会增加SUV39H1水平,其他H3K9甲基转移酶不受影响。进一步的实验表明,ASB7SUV39H1相互作用并负向调节SUV39H1蛋白丰度,从而限制H3K9me3水平。蛋白酶体抑制剂可稳定SUV39H1,敲除/过表达ASB7影响了SUV39H1的泛素化水平,体外泛素化测定进一步证明了CUL5ASB7直接泛素化SUV39H1,并通过质谱检测鉴定等实验发现了赖氨酸138位是CUL5ASB7介导SUV39H1泛素化的主要位点,以上结果确定了CUL5ASB7通过泛素-蛋白酶体途径促进SUV39H1降解。
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04、CDK1调控ASB7活性确保H3K9me3的细胞周期动态平衡

研究人员发现,在细胞周期中,ASB7水平变化不大,而SUV39H1水平从S期到M期逐渐增加,并在G1期下降,表明SUV39H1ASB7降解可能受到时间调节。进一步研究发现,ASB7苏氨酸磷酸化可被M期活化的CDK1-Cyclin B1复合物增强,RoscovitineCDK1抑制剂)对CDK1的抑制导致SUV39H1不稳定,意味CDK1介导的磷酸化可能抑制ASB7。ASB7锚蛋白重复序列接头内的T119、T152、T216位点质谱鉴定为磷酸化位点。研究人员通过定制ASB7-pT216特异性抗体实验发现,在细胞周期内,ASB7-pT216CDK1-Cyclin B1活性和SUV39H1水平同步波动。磷酸化突变体T3E消除了ASB7泛素化及降解SUV39H1的能力,而非磷酸化突变对ASB7功能无影响。综上,ASB7M期被CDK1-Cyclin B1磷酸化后,抑制了SUV39H1的降解,该机制确保了细胞周期中H3K9me3的有效恢复。
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05ASB7抑制H3K9me3使癌细胞对PARP抑制剂敏感

TCGA分析显示,ASB7在多种癌症类型中频繁扩增,ASB7升高会抑制H3K9me3,这可能损害DNA修复、增加基因组不稳定。实验表明,多西环素诱导ASB7表达减少了同源重组(HR),由于HR缺乏会使肿瘤细胞对聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂(PARPi,如奥拉帕尼)敏感。ASB7细胞过表达及异种移植模型证实,ASB7野生型过表达增加了癌细胞对奥拉帕尼的敏感性,提示ASB7高表达患者可能是PARPi治疗的潜在响应人群。
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综上所述,本研究发现了CUL5ASB7 E3泛素连接酶通过ASB7靶向降解H3K9me3 甲基转移酶SUV39H1,限制其过度修饰,维持H3K9me3稳态。ASB7过表达导致H3K9me3降低、同源重组修复受损,使肿瘤对PARP抑制剂敏感,揭示了“HP1-SUV39H1-ASB7”动态回路在表观遗传和肿瘤治疗中的关键作用。

全文链接:ASB7 is a negative regulator of H3K9me3 homeostasis. Science. 2025 Jul 17;389(6757):309-316. doi: 10.1126/science.adq7408. 




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